恢复和太平洋阵线的联系后，欧盟此时才终于得知了日本遭到cN部队占领的消息，太平洋阵线的部队撤往了其他还未沦陷的地区，其中一些还未能成功撤离的重要技术人员被留在了那里。
盟军抓住通讯设施重归安全的短暂时间重建了与太平洋阵线的通讯联系，获胜的机会依然是存在的。虽然波西米亚最终还是被苏联攻陷，但好在盟指终于从西格弗里德那里获得了悖论计划的关键情报：这是为将失去一切的人所准备的希望。在上一次世界大战之后，爱因斯坦认为干预时空连续性是极其危险且违背人道主义的。实验中出现的一个又一个牺牲者折磨着爱因斯坦的良心，于是他在临死前决定加密有关悖论计划的全部科研数据和资料。缺少如他一般的天才头脑的支持，悖论计划有可能永久尘封于历史中。但爱因斯坦和他的朋友知道，自由国度的军队或许将再一次需要超时空传送仪的帮助。
爱因斯坦为超时空科技留下了线索，所以人们在必要时可以重新启动这些装置。现在，西格弗里德的命运科技在欧洲领导着这项研究。显然，在日本的太平洋阵线人员也参与了悖论计划的研究，他们的研发由金川工业领导。但不幸接踵而至，cN最终还是参战了，目前他们已经占领了日本的部分地区。若不是尤里的心灵技术已经将这个消息封锁了几个月，盟军早就该得知这一情报。（难道不是情报部的废物才导致了这样的情况么？）为了这一计划的完成，西格弗里德需要撤回这些科学家，因而他决定使用目前仍不稳定的下一代超时空传送仪进行一场赌博，尝试救出被困的科学家。根据科学家们传来的最后讯息，他们躲藏在京都的妙心寺之中。
“他又一次拯救了盟军。”盟指得知悖论计划的由来后感叹爱因斯坦的远见。“是的，教授还是为我们留下了后手，时间的错误只能由时间来弥补。他在生命的最后时间里经常对我这么说。”西格回应。
“我们能调动的部队有多少?”盟指问副官。“所剩无几，只有一名特工待命，他事先准备了一台长剑机甲。”
“长剑机甲，怎么样的军备？”盟指问。
“长剑步兵装甲在太平洋阵线的地位和其他盟军子阵营的步兵战车相同。这种步兵装甲还具有一些独有的优势：相比于其他的步兵战车，它装备了经过强化的炮塔，使它能够更快地应对即将到来的威胁，它拥有更高的载员存活率，并且完全不受诸如辐射，毒气之类的不良环境影响。这种曾被用于执法的机器人，最初的计划是要将其全自动化。然而全自动化机甲的人工智能系统在东京的某次示范演习中发生了故障，导致了一名企业家被误杀。这个计划因此不得不被废弃，改为由一名驾驶员来驾驶。”副官把长剑机甲的资料告诉了盟指。
“AI控制的武器么？我记得我们以前也开发过类似的武器，后来因为AI失控被放弃了。”盟指对这种武器很感兴趣。
“本次任务所用的长剑机甲原型机需要一名驾驶员才能运作。我们的特工可以胜任。”副官提醒盟指别想直接交给AI运作，还得由他指挥。
“那就开始吧。”盟指得知基本情况后连接上了指挥系统，开展营救行动。
“为了保证超时空传送的安全性，我们准备了一辆战斗要塞，把营救出来的科学家集中放置在里面准备传送。”西格提醒。
“明白。”
日本京都，妙心寺。cN的部队和太平洋阵线的叛徒部队正在附近搜寻着这些科学家的身影。盟军潜藏于此处的特工找到了潜藏在此的长剑机甲原型机，“谢了伙计，我又欠你一个人情了。”特工对着帮自己送到任务目标的合作伙伴说道。
“没事儿，这是你帮我的报答。”特工的线人把特工送到长剑机甲的原型机附近后就离开了，他要去找一个女孩儿。
“指挥官，我已就位。”特工爬上长剑机甲原型机向盟指报告。
盟指看向地图上已经被副官标记好的四位科学家的位置，心中已经拟定好路线，“开始行动。”他下达了命令。
“指挥官，鉴于长剑机甲并不适合面对苏军的装甲部队。所以我建议不要和它们产生正面冲突。”副官建议盟指。
长剑机甲原型机启动后的第一目标是到东南角的一处废弃基地里找到一个补给箱，里面装有一些备用配件可以用来强化机甲的火力。
取得补给后机甲大踏步地到达了科学家A的所在位置附近，苏军的小队在寻找过程中被长剑机甲的机炮杀死。
“哦，谢天谢地。终于有人来救我们了。”科学家A确认周围没有埋伏后提着满载着资料的手提箱走出了躲藏地。
“指挥官，每一位科学家都可以通过他们手里掌控的资料在长剑机甲原型机里组装一种新武器。”
小心绕过巡逻的坦克，向着第二位科学家所在地前进。苏军在此地还部署有女娲加农炮这种重型火炮，长剑机甲的护甲可挡不住它的轰击。
科学家b带出来了一个修理箱帮助长剑机甲修复了损伤。
科学家b所掌握的武器是一种特制的光棱科技，他利用手头的资料在长剑机甲上攒出来一台光棱炮。
盟指靠着这台光棱炮把挡路的炮台打掉后发现了科学家c，如此一来已经有三位科学家被找到，只剩下最后一位距离相对较远的科学家了。
等待科学家们集合完毕，盟指指挥特工驾驶着长剑机甲向最后的目标前去。
长剑机甲的载员位有限，科学家们提着资料艰难地跟在长剑机甲原型机后面，盟指焦急地看着远远落在后面的科学家却毫无办法。
特工在前方开路，扫清一切障碍。为了避开巡逻的装甲部队，他们走的是遍布树林的地区。路况不好长剑机甲原型机完全可以克服，后面的科学家可就遭老罪啰。
有惊无险的行进过后，盟指发现营救部队和最后一名科学家之间有重兵把守，自己手里缺乏对抗重型单位的武器。
这时候科学家A给盟指提议在不远处的一处采矿场里还有一名忠于太平洋阵线的重装大兵，他可以帮助盟指解决问题。
事不宜迟，科学家们藏在树丛里，盟指指挥长剑机甲原型机朝着采矿场而去。
一路上并没有发现什么异常，除了躲避苏军巡逻的麒麟坦克以外并没有发生什么意外。趁着矿车外出采集矿石时溜进去了采矿场当中联系上那位重装大兵，顺便帮助他消灭了追击的部队。
带着重装大兵的长剑机甲原型机破坏了挡在盟指面前的障碍。最后一名科学家终于回归了盟军。
接下来就是带着科学家们前往撤离点了，那里会有提前安排好的车辆帮助他们撤离。
“指挥官，西格会在十分钟后投放超时空传送，请在此之前把科学家们送到撤离点。”
撤离点距此并不远，长剑机甲很快就为科学家们扫清了前进路上的障碍，四名科学家成功登上了玄武战斗要塞。
“这么快，真是让人惊讶。指挥官。”操作超时空传送仪的西格提前释放了超时空传送，玄武战斗要塞驶进了超时空漩涡。
科学家们被安全传送到了德国境内，这使得盟军高层们都松了一口气。同时这也让盟军意识到超时空传送仪是一种不可或缺的强大武器，这次行动的顺利成功也是给盟军的将士们吃了一颗“定心丸”。
然而一波未平一波又起，“指挥官，坏消息。科学家们并没有传送到预定地点，根据定位显示，传送地点偏离了几公里，他们被直接传送到了黑森林的战场上。”
“该死，马上组织周围所有部队朝着目标位置靠拢，我马上就到。”盟指顾不上休息，准备投入下一场营救行动当中。
而此时，苏俄与cN的部队正在对黑森林以及命运科技实验室发起猛攻。盟军指挥官和西格弗里德不得不再次披挂上阵，亲自护送科学家们安全抵达。
“任务完成，指挥官。”东京，隐秘特工成功捕获了目标人物，正在等待上级指令。
“准备撤离。”