千户及其手下的士兵目睹此景，皆瞠目结舌，根本来不及做出任何反应。紧接着，王承恩便开始宣读圣旨。
圣旨的内容主要是详尽列举这些将领的种种罪状，像贪污公款、吃空饷、非法走私以及与京城朝廷人员相互勾结等等。这些罪名一经披露，让一些此前并不知晓内情的士兵内心受到极大震动。圣旨的最后，严令所有士兵放下武器，接受审查。
圣旨宣读完毕之际，在山西镇外隐匿多时的九千锦衣卫恰好赶到，将所有士兵团团围住。这些锦衣卫之前是不能跟随王承恩他们一同进城的，否则，总兵必然会有所警觉，毕竟这可是多达一万的锦衣卫。正因如此，他们直到此刻才现身。
早已混进边军的密阁成员，率先带头扔掉兵器。人嘛，往往都有从众心理，有人开始行动，那剩下的人也就纷纷跟风效仿，这是崇祯专门给混进来的密阁成员下达的命令。
至此，整个山西镇的局势已然被控制住大半。在这个皇权至上的时代，圣旨一出，再加上锦衣卫的威严，即便没有后续这九千锦衣卫的出现，他们其实也不太敢公然反抗。主将皆已殒命，千户也尽数被锦衣卫所控制，已然到了无人能够组织反抗的地步。
再者，这些年来，他们当中大部分人的饷银发放本就不足，如今圣旨说得明明白白，其中有一部分竟是被这些将领贪污了，如此一来，他们就更不愿意反抗了。
接下来的操作就相对容易许多，依据密阁提供的情报，那些思想容易转变的，就开始对其进行洗脑；而那些有前科的，则直接拖到角落处置掉。还有那些洗脑的没效果的，也通通处死，乱世只能用重典。
同一时间，九千锦衣卫开始分兵，前往山西镇下辖的其他卫所实施控制。如今所有将领均已不在，卫所那边见是锦衣卫前来，也都未作反抗，锦衣卫很快就顺利接管了所有卫所。至此，山西镇被曹变蛟和王承恩彻底掌控。
剩下最大的难题就是山西府的行政中心——太原城。这里有巡抚，还有总督，此等皆属一方大员，若没有极具分量的人物出面，恐怕难以将其镇住。
此时，就需要某位大人物登场了，那便是——英国公张维贤。他身旁带着的锦衣卫镇巡使也是一位高手，此人是与朱友贞同科的榜眼，亦是当时朱有贞所推举的几人之一。
他的职位与朱友贞相同，然而在锦衣卫内部众人皆知，他的级别稍低一些。为何如今处于同级别呢？原因很简单，这朱有贞和他，都是通过武举刚刚崭露头角，不能给予过高的官职，能给到四品已然是很高的待遇，若再往上提拔，大臣们定然不会同意。而且这几人所统领的并非仅仅千人，给予千户之职也不太合适。所幸都给了镇抚使一职，待这次山西之事结束以后，再将他们分别晋升到应去的职位。
山西的巡抚一大早便接到通报，英国公带着皇上的圣旨来了，当即被吓得心惊胆战。朝堂那边他是有关系的，可是却无人给他传递消息说近期会有朝廷的旨意送达。
所以他满心疑惑，甚至还揣测自己在朝中的关系是否已被拔除？但想来也不应如此。毕竟他们同属一个党派，不可能人一下子都没了吧。
来的可是张维贤，他是丝毫不敢怠慢的，一边如此思量着，一边赶忙出府迎接。等到见到来人时，所有的顾虑暂且被压下，因为前来的不仅有张维贤，还有太监，更有一千的锦衣卫，圣旨也一直被这位老国公郑重托举着，这般阵仗，毫无疑问是真的，毋庸置疑。
和偏关的情况相同，召集官员、衙役，并请来了总督，反正大大小小的官员都被召集而来，光是召集众人就耗费了一个上午的时间。因为张维贤表示圣旨内容与起义军有关，所有官员都要听旨，而且还专门调来了一部分总督的兵马。锦衣卫依照密报点完官员人数之后，向张维贤不动声色地点点头，张维贤随即展开了圣旨。
尚未开始宣读，这边锦衣卫就展开了血腥的屠杀，所有官员无一幸免。接下来的流程和偏关如出一辙，宣读圣旨，掌控府衙。剩下的衙役和总督的兵马自然是不敢轻举妄动。这一千锦衣卫的威名，早就将他们震慑住了，不少人甚至忍不住叫好，感叹陛下终于开始惩治这些贪官了。
其他州县的情况则更为简单，诸如县令这类级别的官员，见到手持圣旨的公公和锦衣卫，皆吓得魂飞魄散。
当日，整个山西的府衙、县衙便都被秘密地控制住了。所有人都未曾察觉，整个山西已然发生了天翻地覆的变化。
山西这个地方，说白了就是处在一片山区之中，只要掌控了各个隘口，就会形成进不来也出不去的局面，这也是崇祯选择山西的原因之一。
第二日开始，所有府兵、边军都丧失了反抗的勇气，锦衣卫于是抽调大半人员，前往各个隘口进行驻守。只有一条命令，关闭城门，不许进，也不许出。有人不听话，直接斩杀，无需向上禀报。
每个县里面，剩下的锦衣卫，都集结到了州府，以防生变。而那惨绝人寰的屠杀任务，就交给那些刚刚降服的边军了。经过一天一夜的洗脑，边军中已有将近两万人差不多能够胜任。
启用他们，主要是因为锦衣卫人手不足，又不能干等着，毕竟多等一天消息就多一分泄露的风险，也只能赶鸭子上架了。反正各个隘口都已有锦衣卫驻守，就算这些人反叛，只要不出山西，局势仍在可控范围之内。
曹变蛟第二天就率领这两万人出发了，从北向南，一个县一个县地推进，一个镇一个镇地清查，一个村一个村地屠戮。
张维贤这边也对总督的这两万人马进行了筛选，如今还剩下一万五千人，这兵马都是招募而来，都是些走投无路、活不下去的人，所以其中需要清理的人相对较少。经过简单的洗脑之后，这些人也纷纷上岗。
他们在锦衣卫的带领下，前去协助那两万边军。毕竟那两万人是不停留的，杀完就走，总得有人收拾残局，比如妥善安顿地主家的奴仆，收拾他们的家产并运回太原城。
至于那些安抚百姓、维护秩序的工作，则交给了那些经过各队锦衣卫筛选并且进行了简单洗脑的原来的府县衙役。
边军在这个时候必须加快进度，越早完成清洗，山西就越安全。要是消息不慎走漏，那位于山西南面的一些地主之类的人物听闻在对他们进行诛杀，必然会设法出逃，或者联合起来抵抗，那样又得大费周章。
整整用了十天的时间，两万边军才从山西的北方，一路杀到了南方。
而在山西局势差不多掌控的时候，王承恩就带着孙传庭秘密返回了京城，然后才有了，孙传庭汇报山西被叛军占领，朱友贞带领锦衣卫出征平叛的发生。