赵凡成功守护了阿罗拉地区，而他也将继续踏上寻找黑暗盟总部，彻底摧毁这个邪恶组织的征程。
从而赵凡立即决定去阿罗拉地区的联盟去找阿罗拉地区的冠军和天王一起找寻黑暗盟在阿罗拉地区的分盟赵凡来到阿罗拉联盟，见到了冠军和各位天王。
他向他们说明了来意，冠军微微点头，严肃道：“黑暗盟一直是阿罗拉地区的隐患，我们也一直在寻找他们的分盟，如今有你加入，或许能加快进度。”天王们也纷纷表示愿意一同行动。
于是，众人开始搜集线索。经过一番探查，他们得知黑暗盟分盟似乎隐藏在阿罗拉某座神秘岛屿的深处。众人立即出发，乘船前往那座岛屿。
当他们登上岛屿，一股阴森的气息扑面而来。突然，一群黑暗盟的喽啰从树林中窜出，向他们发起攻击。
赵凡和冠军、天王们立刻召唤出各自的宝可梦，展开激烈战斗。在宝可梦们的强大攻势下，喽啰们很快就被击败。可他们还没来得及喘息，前方又出现了更强大的黑暗盟干部，一场更为艰难的战斗即将拉开帷幕。
黑暗盟干部冷笑一声，双手一挥，召唤出了几只实力强劲的宝可梦。
这些宝可梦气势汹汹，眼神中透露出邪恶的光芒。冠军神情凝重，大声喊道：“大家小心，这干部不好对付！”
赵凡深吸一口气，指挥着自己的宝可梦率先冲了上去。
冠军和天王们也不甘示弱，各自的宝可梦纷纷使出绝招。
一时间，岛上光芒闪烁，技能碰撞的声音震耳欲聋。
战斗陷入了胶着状态，黑暗盟干部的宝可梦十分顽强，不断地发起反击。
就在大家有些吃力的时候，赵凡突然发现干部的一只宝可梦出现了破绽。
他抓住时机，指挥自己的主力宝可梦使出了致命一击。那只宝可梦被击中后，瘫倒在地，失去了战斗能力。
干部的脸色一变，有些慌乱。趁着这个机会，冠军和天王们也加大了攻势。
最终，在众人的齐心协力下，黑暗盟干部被击败。他们继续向岛屿深处进发，隐隐约约，已经能看到黑暗盟分盟的轮廓，一场更大的挑战还在等着他们。
众人刚靠近黑暗盟分盟，便触发了机关。无数尖刺从地面突起，宝可梦们纷纷躲避。紧接着，分盟大门缓缓打开，走出一个身材高大的神秘人。
他身后跟着一群精英宝可梦，每一只都散发着强大的气场。神秘人冷冷一笑：“就凭你们也想捣毁这里？简直是自不量力。”
说罢，便指挥宝可梦发动攻击。战斗再次打响，神秘人的宝可梦配合默契，攻击十分凌厉。赵凡和冠军、天王们的宝可梦渐渐有些招架不住。
就在局势危急之时，赵凡突然想到之前在岛上发现的一处神秘能量源。
说时迟那时快！只见他眼神一凛，口中念念有词，双手不断地挥舞着，指挥着身边的宝可梦们迅速行动起来。这些训练有素的小精灵们立刻心领神会，它们紧密配合，将所有的力量都汇聚到了一起，并如潮水般涌向那个神秘人手中的一只关键宝可梦。
而就在这惊心动魄的一刻，他身形一闪，如同鬼魅一般，以迅雷不及掩耳之势朝着那处散发着奇异光芒的能量源疾驰而去。眨眼间，他便来到了能量源前，毫不犹豫地伸出手去触碰它。
刹那间，一道耀眼夺目的光芒从能量源中迸发而出，犹如一轮旭日东升，照亮了整个空间。紧接着，一股无法形容的强大力量如汹涌澎湃的洪流般疯狂地涌入他的身体之中。
就在这千钧一发之际，赵凡拿出神奇宝贝球，放出闪电鸟和火焰鸟！只见天空中划过一道耀眼的雷光，紧接着一只身披电芒、威风凛凛的闪电鸟从天而降；与此同时，一团熊熊燃烧的烈焰腾空而起，化作一只浑身散发着炽热气息的火焰鸟。赵凡深深地吸了口气，他能感觉到一股炽热而狂暴的力量正在他的身体里奔腾不息。这股力量如此强大，以至于让他有些喘不过气来，但他并没有退缩，反而咬紧牙关，用尽全身力气去引导它。
只见他双手紧紧握住，掌心处泛起一层淡淡的青光，那青光如同涟漪一般迅速扩散开来，最终与他周身涌动的气流融为一体。紧接着，他猛地睁开双眼，眼中闪过一丝决然之色。
刹那间，赵凡体内原本就已经极为汹涌澎湃的力量如决堤的洪水般喷涌而出，源源不断地朝着他身前的两只神兽汇聚而去。这些力量犹如一条条金色的巨龙，在空中盘旋飞舞着，然后一头扎进了闪电鸟和火焰鸟的身躯之中。
伴随着能量的疯狂灌注，闪电鸟和火焰鸟的羽毛开始散发出耀眼夺目的光芒。那些光芒越来越亮，越来越热，宛如两轮燃烧的烈日悬挂在半空中，令人不敢直视。
与此同时，两只神兽也感受到了自身实力的提升，它们昂首挺胸，翅膀用力一挥，带起一阵狂风呼啸而过。
随后，它们张开嘴巴，发出两声惊天动地的鸣叫。那声音响彻云霄，仿佛要将整个天地都撕裂开来，又似乎在向全世界宣告：一场前所未有的震撼表演即将上演！
刹那间，天空中划过两道耀眼的光芒！闪电鸟与火焰鸟如同离弦之箭一般，径直冲入了那片被黑暗笼罩着的战场之中——那里正集结着黑暗盟干部所掌控的庞大改造神奇宝贝大军。它们毫不畏惧地投身于战斗，全身散发出令人胆寒的气息。
紧接着，一道道绚烂夺目的技能从这两只强大的神奇宝贝身上喷涌而出：闪电鸟口中吐出粗壮的电流，如银蛇般舞动；而火焰鸟则张开翅膀，熊熊烈焰腾空而起，宛如火龙咆哮。每一次攻击都精准无误地击中目标，让那些原本气势汹汹的敌人纷纷狼狈逃窜。
眼见形势不妙，黑暗盟的干部立马放出被改造的四只神兽（阿罗拉地区的四神兽基因改造出来的），召唤出四只神秘莫测、威风凛凛的神奇宝贝。这些神奇宝贝并非普通之物，而是由四神兽的基因经过精心改良后孕育而生。尽管由于分盟改造工厂的设备相对落后，其技术尚不够完善，但即便如此，这些经过强化的神奇宝贝依然拥有着超乎寻常的力量和能力。
看到四只改造神奇宝贝出来，赵凡立马提醒到，要小心卡噗鳍鳍的心灵之水，她能控制神奇宝贝。
听完赵凡的话，阿罗拉地区的冠军和天王立马打起十二分精神。赵凡见状立马指挥火焰鸟和闪电鸟先攻击卡噗鳍鳍，让她没时间使用心灵之水那种控制神奇宝贝的技能。